MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 plasmid pcpWSRTE30

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018640	TCT	2	6	22	27	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018640	CAG	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018640	GAA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018640	GGT	2	6	192	197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018640	GGT	2	6	214	219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018640	TA	3	6	1266	1271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018640	GAT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018640	T	6	6	1301	1306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018640	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018640	AAT	2	6	2389	2394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018640	TTG	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018640	A	8	8	4874	4881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018640	TTAAA	2	10	4882	4891	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018640	TTAA	2	8	5727	5734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018640	AT	3	6	5735	5740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018640	T	8	8	5753	5760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018640	A	6	6	5774	5779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018640	GA	3	6	5798	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018640	AAG	2	6	6937	6942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018640	T	7	7	6950	6956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018640	TAG	2	6	7063	7068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018640	GAA	2	6	7092	7097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018640	TACT	2	8	7126	7133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018640	ACA	2	6	7157	7162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018640	GA	3	6	7177	7182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018640	A	6	6	7208	7213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018640	ACA	2	6	7230	7235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018640	GCCT	2	8	7315	7322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018640	CCT	2	6	7479	7484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018640	TCT	2	6	7491	7496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018640	CAGA	2	8	7497	7504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018640	GT	3	6	7508	7513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.